Blank template

DNA codes with n = 32, d = 27

Apply homopolymers constraint on the union of the cosets(cosets of Kerdock code and Hadamard code of length 32 ):

[TACGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, GTACAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, CGTATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, ACGTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, TACGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, GTACAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, CGTATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, ACGTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, GACGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, CTACAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, AGTATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, TCGTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, GACGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, CTACAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, AGTATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, TCGTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, CACGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, ATACAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, TGTATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, GCGTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, CACGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, ATACAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, TGTATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, GCGTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, ATAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, TGTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, GCGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, CACTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, ATAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, TGTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, GCGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, CACTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, GTAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, CGTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, ACGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, TACTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, GTAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, CGTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, ACGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, TACTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, CTAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, AGTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, TCGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, GACTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, CTAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, AGTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, TCGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, GACTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, AGAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, TCTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, GAGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, CTCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, AGAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, TCTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, GAGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, CTCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, TGAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, GCTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, CAGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, ATCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, TGAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, GCTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, CAGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, ATCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, CGAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, ACTCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, TAGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, GTCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, CGAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, ACTCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, TAGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, GTCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, ACAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, TATCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, GTGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, CGCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, ACAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, TATCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, GTGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, CGCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, TCAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, GATCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, CTGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, AGCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, TCAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, GATCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, CTGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, AGCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG, GCAGCTGAGCGCGCATATGCGCATATGCGCAT, CATCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, ATGATCAGATATATGCGCATATGCGCATATGC, TGCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, GCAGCTGAGCGCGCATGCATATGCGCATATGC, CATCAGCTCACACATGCATGTGCACATGTGCA, ATGATCAGATATATGCATGCGCATATGCGCAT, TGCTGATCTGTGTGCATGCACATGTGCACATG]

Apply GC-content and Hamming distance constraint with seed codewords TAGCAGCTCACACATGTGCACATGTGCACATG, TGCATGCGTCACAAGTGTCTGTACACGCATAC for d = 27:

[ACGTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, TCGTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, CACTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, GACTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, CTCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, GTCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, AGCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA, TGCTGATCTGTGTGCACATGTGCACATGTGCA]

Last Update
4/10/2023 1:26:13 AM